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核酸酶研究往事IV—PCR的事,你知道和不知道的

2022-08-02 15:47:08

撰文--胡振新博士(美国迈阿密大学生物化学博士、苏州点晶生物科技有限公司董事长)


PCR的事,你知道和不知道的


PCR开创了生物技术的新起点,自PCR发明之后,科学家可以很容易的获得自然界存在的核酸片段,极大的促进了生物科学和应用的发展。许多故事经过多次演绎到了几乎失真的程度,那么PCR有哪些不为大家所熟悉呢。


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(1)PCR开始是在水浴锅里进行的,三个温度很分明,分别是解链,退火,和延伸,由一个机械臂把试管从一个锅移到另一个锅。因为没有热盖,为了防止水分挥发,需要在溶液上加石蜡油。

水浴锅



(2)三个温度中延伸温度是37°C而不是现在通行的72°C,因为最初Mullis想到的是当时常用的聚合酶——Klenow。而Klenow是不耐热的,所以每次退火之后,在延伸之前,要向反应试管中加入新的Klenow酶,最初做PCR是一件非常耗时的工作,也是体力活。

Klenow酶



(3)Taq酶的发现是在1976年,是从黄石国家公园的温泉里耐热菌株里分离到的。在Taq酶得到应用之前,研究生物的人是不大受待见的,大家的总笑话,研究这些有什么意义啊?根本没什么用嘛。Taq酶被应用于PCR之后,被Science评为当年的年度。而第一个分离Taq酶的是华人学者钱嘉韵,她当时在辛辛那提大学读书,发表这篇文章后她没有再从事这方面的研究,而是转学去了爱荷华。钱嘉韵现在是台湾阳明大学的神经系教授。

钱嘉韵



(4)PCR技术发明后,这个组的其它成员因为这个项目,每个人获得了象征性的1美元的奖励,Mullis那时要离开Cetus公司,得到了10,000美元。而罗氏公司收购Cetus的时候,为PCR专利支付的转让费用是100,000,000美元。

Cetus公司



(5)荧光定量的发现是从实验error开始,做完PCR后,加入核酸染料再电泳是正确的流程,但是一个做实验的在配液的时候把染料液放进去了,然后观察到荧光随着循环数发生了变化,所以染料法的荧光定量技术就产生了。



(6)热启动PCR的方法,有化学法修饰Taq酶和抗体修饰Taq酶,但是修饰Taq酶并不是唯一热启动的方法,当然它是目前应用最广泛的方法。

基于抗体热启动技术的DNA聚合酶


(7)可以选择热启动引物,引物3’端羟基被化学基团封闭,温度较低的时候,反应无法延伸,在加热时候解除,进行特异性扩增。

(8)可选择热启动dNTPs, 如上,温度低时候,反应无法进行,加热后解除抑制,扩增反应开始。(有商业化的产品)


(9)可控制Mg(II),有几种方法,一种是让Mg离子在低温下沉淀,升温后,Mg(II)溶解,反应开始进行。(Roche有专利描述这种方法)

(10)其它方法,把PCR反应的某种成分包裹在热敏材料里,在升温后释放到反应液里,反应开始。或者是用一种突变的酶,它无法催化延伸反应,而且温度敏感,温度低的时候,它阻止非特异性延伸,但是升温后它结合核酸的能力变弱,Taq酶催化反应开始(Stratagene申请过类似专利)



(11)以上(6)-(10)都是利用了PCR升温的特点,利用光敏材料,把某些组分封闭起来,然后在特定时刻点用特定波长的光来启动反应。


(12)除了三个温度循环的PCR,也有两个温度的循环的PCR,还有一个温度的PCR,就是等温PCR。通过一个细长的反应试管,没有热盖,整个反应液上下有一个温度差,解链,退火,延伸在不同的温度区域进行。

 


你还知道哪些不为多数人知道PCR的逸闻趣事呢?



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